这篇文章将为大家详细讲解有关lncRNASNP数据库有什么用，小编觉得挺实用的，因此分享给大家做个参考，希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获。

成都创新互联公司-专业网站定制、快速模板网站建设、高性价比富拉尔基网站开发、企业建站全套包干低至880元,成熟完善的模板库,直接使用。一站式富拉尔基网站制作公司更省心,省钱,快速模板网站建设找我们，业务覆盖富拉尔基地区。费用合理售后完善，10余年实体公司更值得信赖。

lncRNASNP数据库收集整理了人和小鼠中位于lncRNA基因上的SNP位点信息，通过以下两种思路将lncRNA与SNP结合起来

1. 探究SNP位点对于lncRNA结构的影响

2. 分析SNP位点对于lncRNA与miRNA结合的影响

除此之外，还提供了lncRNA,SNP在TCGA数据库中的相关信息，比如lncRNA在各种肿瘤中的表达谱，SNP位点在各种疾病中的突变情况。该数据库的网址如下

http://bioinfo.life.hust.edu.cn/lncRNASNP2

对于一个lncRNA, 包含了以下几种信息

1. 基本信息

2.  位于lncRNA上的SNP位点

包含以下3种来源的SNP位点

1. dbsnp

2. TCGA

3. Cosmic

以dbsnp数据库为例，结果示意如下

3. lncRNA相关疾病

包含lncDisease数据库中提供的实验证据支持的相关疾病和使用TAM软件预测的信息，示意如下

4. lncRNA与miRNA结合位点信息

采用软件预测lncRNA与miRNA结合区域信息，一个lncRNA会存在多个miRNA结合位点，示意如下

点击每个miRNA，可以看到软件预测的详细结果

采用了Pita, MiRanda, TargetScan3款软件进行预测。

4. SNP位点对lncRNA-miRNA结合的影响

包括以下两种影响

1. gain

2. loss

gain指的是原本lncRNA与miRNA没有结合位点，突变之后的lncRNA与miRNA存在结合位点，loss则与之相反，示意如下

5. lncRNA在TCGA数据库中的表达谱

采用柱状图的形式展示在不同肿瘤中的表达谱数据，示意如下

官网还提供了在线工具，可以分析突变位点对于lncRNA-miRNA结合的影响以及SNP对于lncRNA二级结构的影响，如下所述

1. 突变位点对lncRNA-miRNA结合的影响

只需要输入lncRNA的野生型序列和突变型序列，采用上述的3种软件预测miRNA与两种序列的结合位点，从而分析突变对于lncRNA-miRNA结合的影响，示意如下

2. SNP对于lncRNA二级结构的影响

采用RNAsnp软件预测snp位点对于lncRNA二级结构的影响，示意如下

官网还提供了很多的功能，具体用法请移步官网自行探究。

关于“lncRNASNP数据库有什么用”这篇文章就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，使各位可以学到更多知识，如果觉得文章不错，请把它分享出去让更多的人看到。

网站题目：lncRNASNP数据库有什么用
当前网址：http://njwzjz.com/article/gjiiep.html