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在很多人学习Linux命令行，会经常遇到command not found 错误，出现上述错误主要有以下几种情况：
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命令书写错误，如有些人将Windows命令与Linux命令搞错，如查看ip相关信息，Linux命令行应该为ifconfig
环境变量没有配置好，这里一般有两种解决方法，第一，可以切换到root用户执行命令，第二种，就是配置用户的环境变量，其指令如下：
export PATH=/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin
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Linux命令找不到？（找不到命令）
这个问题其实很简单，如果你在终端输入一个命令，而系统提示你说命令没有找到（Command not found）的话，要么是因为你没有装相应的软件包，要么就是因为路径设置的问题。如果是因为软件包的问题，那没有别的好说的，安装相应的软件包就好了。而另外一种情况，则需要对用户的路径进行设置。这里针对普通用户和超级用户分开介绍，以 RedHat 些列为例。
一、普通用乎如果一些程序没有安装在系统默认的路径(ie /bin/, /usr/bin, /usr/local/bin/ )里面，这个时候普通用户想要调用这些命令，必须设定路径。方法很简单：以普通用户登录，然后在终端输入：
vi ~/.bash_profile
会出现如下的内容：# .bash_profile
export PATH此时，只要在export PATH前面加入自己的路径即可，例如我的修改后如下：[ @localhost bin]$ cat ~/.bash_profile# .bash_profile# Get the aliases and functionsif [ -f ~/.bashrc ]; then . ~/.bashrcfi# User specific environment and startup programsPATH=$PATH:/usr/local/programs/crosstool/gcc-4.0.2-glibc-2.3.6/arm-linux-gnu/bin/export PATH
二、超级用户这里主要是一些用在系统管理上的命令，例如ifconfig, route等等， 他们位于/sbin, 或/usr/sbin/下。其实这些命令本身就没有任何问题，软件包早已安装完毕，路径设置也没有丝毫问题。而出现Command not found的原因在于：在终端使用su变成超级用户的时候没有将root的路径（环境）一起切换过来，从而导致身份虽然已经是root，但是工作的环境和路径依旧是普通用户的。这种问题的解决方法有两个，其一是按照（一）里面提到的，对普通用户的工作路径进行修改，但是这样比较麻烦。其二则简单的多，只要在使用su的时候在其后家上一个空格和”-“ ，即将su改为 su - 。这样就可以在成为root的同时将root的工作路径也一起切换过来了。如果你已经使用su变成了root，那也没有关系，只要在输入一下su - 就好了。
原文地址：
本文讲述了linux命令行乱码的解决方式，以下为具体操作步骤：
想解决linux命令行乱码，只要打开/etc/sysconfig/i18n这个文件，在里面加上如下代码即可：
#LANG="zh_CN.UTF-8"
#SYSF
LANG=zh_CN.GB18030
LANGUAGE=en_US.UTF-8
LC_CTYPE=zh_CN.GB18030
LC_TIME=en_US.UTF-8
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令：
通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：
参数的用法介绍：
注意事项：
用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加 符号，退出时，另起一行，按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默认 10 行 （在R语言里head和tail默认是前6行）。
less命令用得最多 ，more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 ：
需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q键
less命令重要的补充用法2 ：
参数用法：
less命令 不加参数 查看文件：
less命令加 -N参数 查看文件：显示行号
less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整
对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看，按空格翻页，按回车换行 ，more命令一般很少用，熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去，但是别的命令不一定会把换行符算进去，。
常见参数:
切记：用less命令，按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前：
排列后：
解释：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时，因为制表符对齐的原因，出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样，所以 加上-n参数 ， 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重，只有两行出现重复，而且是相邻的两行，如果不相邻，即使出现两行一模一样，不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之，uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1：
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯，原始数据不要轻易修改，修改的东西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上，将空格替换成制表符
补充小知识 ：
清屏 ：control L
查看历史（输入过的）命令 ：history
如果不是自己写的程序，建议先阅读一下文档
是不是文件的权限，目录，环境变量，使用方法等有问题。
如果是自己写的
那么出现段错误 有可能是越界等错误
建议GDB调试，或检查源码
