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这主要通过书面的和实际的比较分析后得出。其实际内容主要是三项:系统功能，各项指标及用户满意程度。
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前两项一般在系统开发各阶段都明确定书面要求。在用户需求调查、需求分析、系统总体设计、详细设计、合同协议等文件中对功能及指标均有相应规定，在罗列及对比后，应予必须的分析。
用户的满意程度在系统评价中往往是一个争议较多的问题，只有在开发方和用户方共同实事求是，平等协商下才能取得较好的解决。
作为GIS系统的建设者的开发方应主动地担负重要的责任，明确GIS是理论和实践相结合的产物，是一个只有在应用中才能体现价值的应用系统，用户至上是一切产品和信息系统的开发原则;而另一方面，对用户而言，又必须明确GIS是一个尚待理论和实践不断完善和补充的高技术系统，它发展很快，一劳永逸是不可能的，有限目标的应用才是现实的。
有几个比较重要的指标一定要用到，坡度、起伏度、高程、土地利用类型，然后就要考虑外界负面影响因素了，比如周边道路的噪声影响、工业区。再考虑外界正面影响因素，如距离公园、学校、医院、商场、车站等便民设施位置，另外可以加上部分地域特色指标进行考量。
GIS的系统评价包含了以下三个指标：
1、一般系统的性能指标: 它主要指GIS稳定性和平均无故障时间; GIS联机响应时间; 处理速度和吞吐量; GIS的利用率; 系统的操作灵活性、方便性、容错性; 安全性和保密性; 加工数据的准确性; 系统的可扩充性; 系统的可维护性等。
2、 专业性能指标:主要指数据的包容性、空间分析的准确性及区域性、可视化的功能及性能等三个方面。
3、经济效益指标:地理信息系统的经济效益由两部分构成:第一部分为成本费用，指系统在开发、运行和维护时产生的各项费用支出;第二部分是系统效益，指系统投入运行后所产生的直接经济效益和间接经济效益。
扩展资料：
MIS的开发必须具有一定的科学管理工作基础。只有在合理的管理体制、完善的规章制度、稳定的生产秩序、科学的管理方法和准确的原始数据的基础上，才能进行MIS的开发。 因此，为适应MIS的开发需求，企业管理工作必须逐步完善以下工作：
管理工作的程序化，各部门都有相应的作业流程; 管理业务的标准化，各部门都有相应的作业规范; 报表文件的统一化，固定的内容、周期、格式;数据资料的完善化和代码化。
信息系统的五个基本功能：输入、存储、处理、输出和控制。
1、输入功能：信息系统的输入功能决定于系统所要达到的目的及系统的能力和信息环境的许可。
2、存储功能：存储功能指的是系统存储各种信息资料和数据的能力。
3、处理功能：基于数据仓库技术的联机分析处理(OLAP)和数据挖掘(DM)技术。
4、输出功能：信息系统的各种功能都是为了保证最终实现最佳的输出功能。
5、控制功能：对构成系统的各种信息处理设备进行控制和管理，对整个信息加工、处理、传输、输出等环节通过各种程序进行控制。
参考资料来源：百度百科——系统评价指标
